研究人员使用CRISPR,使这250个基因逐一失活,以创建250批黑色素瘤细胞的混合物,每个细胞都有不同的突变。然后将整个“编辑后”的癌细胞的混合物暴露于接受检查点抑制剂治疗后的患者T细胞。
之后,作者分离出抵抗被T细胞杀死的细胞,并使用单细胞RNA和蛋白质谱分析测量了这些细胞内所有活跃过程的快照,从而提供了导致免疫逃逸的几种基因扰动的高分辨率分子图。
“我们的方法是独特的,因为我们在患者衍生的模型中研究了这些机制,而不是一次查看一个基因如何改变一个细胞表型的一个基因,我们能够研究许多在患者耐药性中具有潜在作用的基因。” Izar说。